コマンドラインから、実行中の Visual Studio 2013 Express のインスタンスにファイルを開く

残念ながら無理のようです。
Express Edition には devenv.exe がなく、VWDExpress.exe や WDExpress.exe には既存のインスタンスでファイルを開くための /edit オプションがありませんでした。いろいろ検索したのですが、結局方法は見つからず。

一応、ファイルを開く既定のプログラムを Microsoft Visual Studio Express 2013 for Windows Desktop 等にしておけば、

Start file.cs

と Start コマンドを利用することで同一のインスタンスにファイルを開くことができますので、これが代替案となりそうです。